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结晶紫是一种很好的碱性染料，可以和细胞核中的DNA结合，将细胞核染成深紫色。神经细胞中经结晶紫染色的结构称为尼氏小体，这在细胞结构的辨别中非常有用。

该染色液在细胞学、组织学、微生物学方面有着广泛的应用。结晶紫染液还能与其他染色液配合使用。

• 样品制备：
  
  • 培养中的细胞：用4％多聚甲醛固定细胞10～20分钟，然后用蒸馏水漂洗两次，每次2～5分钟。
    
  • 冰冻切片：用蒸馏水洗涤切片两次，2～5分钟。
    
  • 石蜡切片：按照标准的实验操作过程进行脱蜡、水化后，用蒸馏水漂洗2分钟。
• 结晶紫染色：加入适当体积的结晶紫染色液（组分A），室温孵育10～30分钟。
  
  • 最佳的染色时间及浓度，根据细胞类型以及实验目的的不同而不同。
• 用蒸馏水洗涤两次，每次2分钟。
  
• 在显微镜下观察样品。